常见害虫的种类及其特点如下：
菌蚊：包括眼菌蚊、小菌蚊、大菌蚊、茹蚊等。成虫因种类不同，为黑褐色或黄褐色，体长1.8-6毫米。幼虫乳白色或灰白色，体长4.7-16毫米，头黑色。主要以幼虫为害食用菌子实体，也为害培养料和菌丝体，造成子实体枯死或腐烂。
茹蝇：包括黑腹果蝇、茹蝇、菌蝇等。成虫褐色或黑色，触角比菌蚊短，幼虫白色，无头。幼虫无头是与菌蚊的主要区别。成虫常在腐烂的子实体上进食和产卵。幼虫食子实体，造成子实体腐烂，亦能危害菌丝体，使菌丝腐烂。
跳虫：常见的有角跳虫、黑角跳虫、黑跳虫等。体长仅1-2毫米，善跳如蚤。主要咬食子实体，也为害菌丝体。常群居为害，使子实上布满麻坑，重者可尽幼菇和菇蕾。
绒虫：体长仅0.9毫米，绒虫主要危害菌丝体，造成菌丝体成片枯萎死亡。
螨类：有粉螨、食酪螨、草螨、根螨等，形体微小，约和0.2-0.6毫米，肉眼不易看见。
